Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CTC1Q2NKJ3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms