Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SIX1Q15475 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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