Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCKAP1LP55160 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms