Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCP1P17987 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TCP1P17987 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TCP1P17987 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.5 ms