Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC130P13994 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC130P13994 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC130P13994 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC130P13994 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms