Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LTAP01374 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LTAP01374 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LTAP01374 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LTAP01374 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms