Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNIH4Q9P003 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNIH4Q9P003 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CNIH4Q9P003 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNIH4Q9P003 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CNIH4Q9P003 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CNIH4Q9P003 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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CNIH4Q9P003 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CNIH4Q9P003 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CNIH4Q9P003 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CNIH4Q9P003 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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