Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TBCCD1-205ENST00000446782 2186 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms