Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2E2Q96LR5 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms