Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms