Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERVK_113Q902F9 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERVK_113Q902F9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms