Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HERC3Q15034 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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