Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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