Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NPRL3Q12980 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms