Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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