Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FMODQ06828 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms