Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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