Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRCA2P51587 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms