Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LHBP01229 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LHBP01229 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LHBP01229 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms