Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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