Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIRT1Q96EB6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms