Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTF1AQ7RTS3 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms