Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJB2P29033 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms