Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CNTN3Q9P232 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNTN3Q9P232 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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