Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RUSC1Q9BVN2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms