Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 LINC00929-202ENST00000556159 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 TTC38-207ENST00000629918 162 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC073592.1-201ENST00000543970 1282 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC110285.1-201ENST00000572077 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 IQCD-201ENST00000299732 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 NOMO2-210ENST00000620440 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CEP350Q5VT06 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms