Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC96Q2M329 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms