Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 KIAA0040-203ENST00000545251 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 CCDC144CP-201ENST00000340196 2823 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 SYNPO2L-201ENST00000372873 4121 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 BRINP2-201ENST00000361539 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2V1Q13404 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KIR2DL4-205ENST00000396284 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MMP2-203ENST00000543485 1978 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CTBP2-201ENST00000309035 3669 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms