Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA4P13612 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms