Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A6NJR5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
A6NJR5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
A6NJR5 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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