Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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