Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms