Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC174Q6PII3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms