Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRB1P82279 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRB1P82279 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRB1P82279 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRB1P82279 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.4 ms