Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANGAP1P46060 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANGAP1P46060 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms