Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TGFBR1P36897 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TGFBR1P36897 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms