Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATF7P17544 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATF7P17544 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATF7P17544 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms