Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PKHD1P08F94 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms