Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HMGB1P1B2RPK0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms