Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EMILIN1Q9Y6C2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EMILIN1Q9Y6C2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
EMILIN1Q9Y6C2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EMILIN1Q9Y6C2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
EMILIN1Q9Y6C2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EMILIN1Q9Y6C2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
EMILIN1Q9Y6C2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EMILIN1Q9Y6C2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms