Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB2Q9Y5E7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms