Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIKFYVEQ9Y2I7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIKFYVEQ9Y2I7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms