Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1AQ9Y241 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms