Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMG5Q9UPR3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG5Q9UPR3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG5Q9UPR3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms