Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG3

PCYOX1, Prenylcysteine oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYOX1Q9UHG3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCYOX1Q9UHG3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYOX1Q9UHG3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCYOX1Q9UHG3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYOX1Q9UHG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYOX1Q9UHG3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYOX1Q9UHG3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYOX1Q9UHG3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYOX1Q9UHG3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms