Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXF1Q9UBU9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NXF1Q9UBU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXF1Q9UBU9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms