Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CC2D2AQ9P2K1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CC2D2AQ9P2K1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CC2D2AQ9P2K1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms