Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP35Q9P2H5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP35Q9P2H5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
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