Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDFIP2Q9NV92 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms