Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CISHQ9NSE2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CISHQ9NSE2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CISHQ9NSE2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms